Мы решаем медицинские задачи с помощью работающих аптамеров
Отбор аптамеров, характеризация, моделирование 3D-структуры и идентификация мишени
Мы проведём отбор аптамеров — просто нажмите кнопку
ОТБОР АПТАМЕРОВ НУЖЕн
Если вам необходимо обнаружить заданную мишень (белок / клетку / патоген), а лиганд ещё неизвестен
Техники отбора аптамеров будут полезны вам, если ваша задача — разработать элементы распознавания мишени с высоким сродством и специфичностью к различным типам мишеней. Аптамеры — это короткие одноцепочечные молекулы ДНК или РНК (ssDNA или ssRNA), способные избирательно связываться с конкретной мишенью, включая белки, пептиды, низкомолекулярные соединения, токсины, живые клетки, ионы. Они универсальны и связываются с мишенями с высокой селективностью и специфичностью. Связывание аптамера определяется его третичной структурой.
Если вам нужен аптамерный аналог антитела
Этот тип отбора будет полезен, если вы заинтересованы в разработке различных диагностических и терапевтических инструментов для биомедицины на основе аптамеров. Аптамеры могут использоваться как аналоги антител для диагностических, терапевтических и биопромышленных применений.
Если вам нужен аптамер для диагностики или направленной доставки лекарств
Этот тип отбора может быть использован, если вас интересуют быстрые, точные и недорогие диагностические и терапевтические средства на основе аптамеров. Важное преимущество диагностических и терапевтических аптамеров — их химическая стабильность и устойчивость. Они способны восстанавливать свою активность после денатурации и нагревания. Их можно длительное время хранить при комнатной температуре.
ЭТАПЫ ОТБОРА АПТАМЕРОВ
1
Мы отбираем аптамеры к заданной (положительной) мишени с использованием технологий Cell SELEX, Tissue SELEX или LIGs из стандартной библиотеки ДНК олигонуклеотидов на выбор. В результате мы получаем несколько пулов в соответствии с количеством раундов отбора аптамеров. Каждый пул содержит большое количество последовательностей аптамеров с различной эффективностью связывания с мишенью. Контроль качества отбора осуществляется с использованием электрофореза в агарозном геле.
2
Мы отбираем пул аптамеров, обладающий наивысшим сродством и специфичностью к мишени, с использованием проточной цитометрии. Для определения сродства к мишени мы используем позитивную мишень, применённую при отборе (клетки, ткани или другие объекты, против которых проводился отбор). Для определения специфичности — негативные мишени, использовавшиеся в процессе отбора. Полученные данные обрабатываем с помощью программного обеспечения Kaluza 2.0.
3
Мы проверяем данные проточной цитометрии с использованием флуоресцентной или конфокальной лазерной сканирующей микроскопии. Полученные данные обрабатываются с использованием программного обеспечения ZEN.
4
На основе данных проточной цитометрии и микроскопии мы отбираем пул аптамеров с наивысшим сродством и специфичностью к мишени. Если результат неудовлетворителен, мы вводим дополнительные раунды отбора или модифицируем технологию отбора для достижения лучшего результата (без дополнительной платы).
МЫ ИСПОЛЬЗУЕМ ИННОВАЦИОННЫЕ ТЕХНОЛОГИИ
APTABID
AptaBiD позволяет нам выделять белки, связывающиеся со специфическими аптамерами. С помощью этого метода становится возможным определить прямую мишень аптамера.
TISSUE SELEX
Метод отбора аптамеров, способных связываться с тканевыми мишенями
CELL SELEX
Эта технология предполагает отбор аптамеров для целых клеток. Это позволяет получить аптамеры, способные связываться с мишенью в ее нативной конформации.
LIGS
Метод позволяет выявлять высокоселективные аптамеры против заранее определённого эпитопа, экспрессируемого на поверхности клетки. Моноклональное антитело взаимодействует со своим когнатным эпитопом, вытесняя и замещая специфичные аптамеры из обогащённого пула SELEX.
SAXS
Этот метод используется для определения различий в наномасштабной плотности образца. Это позволяет определить размер и форму макромолекулы.
HT SELEX
HT SELEX — метод, повышающий чувствительность по сравнению с традиционными методами клонирования и секвенирования и сокращающий число раундов, необходимых для достижения обнаруживаемого обогащения.
ЧТО ВЫ ПОЛУЧИТЕ
УЧЁНЫЕ, УЧАСТВУЮЩИЕ В ИССЛЕДОВАНИИ
АННА КИЧКАЙЛО
АННА БЛАГОДАТОВА
ОЛЬГА КОЛОВСКАЯ
ГАЛИНА ЗАМАЙ
ЗАКАЗАТЬ ОТБОР АПТАМЕРОВ
УСЛУГИ
-
 
«Деятельность осуществляется при грантовой поддержке Фонда «Сколково»
