Мы решаем медицинские задачи с помощью работающих аптамеров
Отбор аптамеров, характеризация, моделирование 3D-структуры и идентификация мишени
Выполним характеризацию ваших аптамеров — просто нажмите кнопку
ХАРАКТЕРИЗАЦИЯ АПТАМЕРОВ НУЖНА
ЕСЛИ ВЫ ХОТИТЕ ОЦЕНИТЬ СРОДСТВО И СПЕЦИФИЧНОСТЬ АПТАМЕРА
После математического анализа последовательностей, полученных методом секвенирования нового поколения, отбирается до 10 аптамеров, которые затем химически синтезируются. Их специфичность и сродство к мишени оцениваются с помощью проточной цитометрии и микроскопии. Эксперименты по связыванию аптамеров с положительными и отрицательными мишенями проводятся в нескольких повторных экспериментах и подвергаются статистической обработке. В результате анализа отбираются 1-3 аптамера с лучшими характеристиками.
ЕСЛИ ВЫ ХОТИТЕ ОЦЕНИТЬ КОНСТАНТУ ДИССОЦИАЦИИ АПТАМЕРА
Константа диссоциации (Kd) позволяет оценить, при каких концентрациях мишень и аптамер переходят в равновесное состояние. Эта величина позволяет косвенно оценить оптимальную концентрацию аптамеров для связывания. Эксперименты по оценке Kd аптамеров и положительной мишени проводятся с использованием проточной цитометрии.
ЭТАПЫ ХАРАКТЕРИЗАЦИИ АПТАМЕРОВ
1
Сродство аптамеров к целевым тканям, клеткам, бактериям или грибам оценивается с помощью проточной цитометрии.
2
Специфичность аптамеров к отрицательным тканям, клеткам, бактериям или грибам оценивается с использованием проточной цитометрии и лазерной сканирующей микроскопии.
3
Константа диссоциации (Kd) аптамера с мишенью оценивается с использованием проточной цитометрии.
МЫ ИСПОЛЬЗУЕМ ИННОВАЦИОННЫЕ ТЕХНОЛОГИИ
APTABID
AptaBiD позволяет нам выделять белки, связывающиеся со специфическими аптамерами. С помощью этого метода становится возможным определить прямую мишень аптамера.
TISSUE SELEX
Метод отбора аптамеров, способных связываться с тканевыми мишенями
CELL SELEX
Эта технология предполагает отбор аптамеров для целых клеток. Это позволяет получить аптамеры, способные связываться с мишенью в ее нативной конформации.
LIGS
Метод позволяет выявлять высокоселективные аптамеры против заранее определённого эпитопа, экспрессируемого на поверхности клетки. Моноклональное антитело взаимодействует со своим когнатным эпитопом, вытесняя и замещая специфичные аптамеры из обогащённого пула SELEX.
SAXS
Этот метод используется для определения различий в наномасштабной плотности образца. Это позволяет определить размер и форму макромолекулы.
HT SELEX
HT SELEX — метод, повышающий чувствительность по сравнению с традиционными методами клонирования и секвенирования и сокращающий число раундов, необходимых для достижения обнаруживаемого обогащения.
ЧТО ВЫ ПОЛУЧИТЕ
УЧЁНЫЕ, УЧАСТВУЮЩИЕ В ИССЛЕДОВАНИИ
АННА КИЧКАЙЛО
АННА БЛАГОДАТОВА
ОЛЬГА КОЛОВСКАЯ
ГАЛИНА ЗАМАЙ
ЗАКАЗАТЬ ХАРАКТЕРИЗАЦИЮ
УСЛУГИ
-
 
«Деятельность осуществляется при грантовой поддержке Фонда «Сколково»
