Мы решаем медицинские задачи с помощью работающих аптамеров
Отбор аптамеров, характеризация, моделирование 3D-структуры и идентификация мишени
Мы выполним идентификацию и верификацию мишеней ваших аптамеров — просто нажмите кнопку
необходимы идентификация и верификация вероятных белковых мишеней
ЕСЛИ ВЫ НЕ ЗНАЕТЕ МИШЕНЬ АПТАМЕРА И ВАМ НЕОБХОДИМО ЕЁ ОПРЕДЕЛИТЬ
Идентификация наиболее вероятных белковых мишеней аптамера выполняется с использованием масс-спектрометрии. Для выделения белков-мишеней из клеточной смеси применяется технология AptaBiD. Массив этих белков, полученный после масс-спектрометрических исследований, обрабатывается, после чего формируется список наиболее вероятных мишеней.
ЕСЛИ ВЫ ЗНАЕТЕ МИШЕНЬ АПТАМЕРА И ВАМ НЕОБХОДИМО ЕЁ ВЕРИФИЦИРОВАТЬ
Мы предлагаем косвенные методы верификации мишени с использованием антител, специфичных к предполагаемой мишени. Первый метод основан на конкурентном вытеснении аптамеров соответствующими антителами с поверхности клеток. Второй метод позволяет визуализировать области совместной локализации аптамеров с антителами на гистологических срезах.
ЭТАПЫ ИДЕНТИФИКАЦИИ И ВЕРИФИКАЦИИ МИШЕНЕЙ
1
Выделение белков, специфичных к аптамерам, из образца, содержащего клетки или измельчённую ткань, с использованием технологии AptaBiD.
2
Идентификация белков в образце методом масс-спектрометрии.
3
Анализ масс-спектрометрических данных и идентификация вероятных белковых мишеней.
4
Верификация вероятной мишени методом конкурентного вытеснения аптамеров антителами с использованием проточной цитометрии.
5
Верификация вероятной мишени методом колокализации аптамеров и соответствующих антител с использованием лазерной сканирующей микроскопии.
МЫ ИСПОЛЬЗУЕМ ИННОВАЦИОННЫЕ ТЕХНОЛОГИИ
APTABID
AptaBiD позволяет нам выделять белки, связывающиеся со специфическими аптамерами. С помощью этого метода становится возможным определить прямую мишень аптамера.
TISSUE SELEX
Метод отбора аптамеров, способных связываться с тканевыми мишенями
CELL SELEX
Эта технология предполагает отбор аптамеров для целых клеток. Это позволяет получить аптамеры, способные связываться с мишенью в ее нативной конформации.
LIGS
Метод позволяет выявлять высокоселективные аптамеры против заранее определённого эпитопа, экспрессируемого на поверхности клетки. Моноклональное антитело взаимодействует со своим когнатным эпитопом, вытесняя и замещая специфичные аптамеры из обогащённого пула SELEX.
SAXS
Этот метод используется для определения различий в наномасштабной плотности образца. Это позволяет определить размер и форму макромолекулы.
HT SELEX
HT SELEX — метод, повышающий чувствительность по сравнению с традиционными методами клонирования и секвенирования и сокращающий число раундов, необходимых для достижения обнаруживаемого обогащения.
ЧТО ВЫ ПОЛУЧИТЕ
УЧЁНЫЕ, УЧАСТВУЮЩИЕ В ИССЛЕДОВАНИИ
ЮРИЙ ГЛАЗЫРИН
АННА БЛАГОДАТОВА
ОЛЬГА КОЛОВСКАЯ
ГАЛИНА ЗАМАЙ
ЗАКАЗАТЬ ИДЕНТИФИКАЦИЮ МИШЕНИ
УСЛУГИ
-
 
«Деятельность осуществляется при грантовой поддержке Фонда «Сколково»
