Мы решаем медицинские задачи с помощью работающих аптамеров

Отбор аптамеров, характеризация, моделирование 3D-структуры и идентификация мишени

Выполним характеризацию ваших аптамеров — просто нажмите кнопку

ХАРАКТЕРИЗАЦИЯ АПТАМЕРОВ НУЖНА

ЕСЛИ ВЫ ХОТИТЕ ОЦЕНИТЬ СРОДСТВО И СПЕЦИФИЧНОСТЬ АПТАМЕРА

После математического анализа последовательностей, полученных методом секвенирования нового поколения, отбирается до 10 аптамеров, которые затем химически синтезируются. Их специфичность и сродство к мишени оцениваются с помощью проточной цитометрии и микроскопии. Эксперименты по связыванию аптамеров с положительными и отрицательными мишенями проводятся в нескольких повторных экспериментах и подвергаются статистической обработке. В результате анализа отбираются 1-3 аптамера с лучшими характеристиками.

ЕСЛИ ВЫ ХОТИТЕ ОЦЕНИТЬ КОНСТАНТУ ДИССОЦИАЦИИ АПТАМЕРА

Константа диссоциации (Kd) позволяет оценить, при каких концентрациях мишень и аптамер переходят в равновесное состояние. Эта величина позволяет косвенно оценить оптимальную концентрацию аптамеров для связывания. Эксперименты по оценке Kd аптамеров и положительной мишени проводятся с использованием проточной цитометрии.

ЭТАПЫ ХАРАКТЕРИЗАЦИИ АПТАМЕРОВ

1

этап

Сродство аптамеров к целевым тканям, клеткам, бактериям или грибам оценивается с помощью проточной цитометрии.

2

этап

Специфичность аптамеров к отрицательным тканям, клеткам, бактериям или грибам оценивается с использованием проточной цитометрии и лазерной сканирующей микроскопии.

3

этап

Константа диссоциации (Kd) аптамера с мишенью оценивается с использованием проточной цитометрии.

МЫ ИСПОЛЬЗУЕМ ИННОВАЦИОННЫЕ ТЕХНОЛОГИИ

APTABID

AptaBiD позволяет нам выделять белки, связывающиеся со специфическими аптамерами. С помощью этого метода становится возможным определить прямую мишень аптамера.

TISSUE SELEX

Метод отбора аптамеров, способных связываться с тканевыми мишенями

CELL SELEX

Эта технология предполагает отбор аптамеров для целых клеток. Это позволяет получить аптамеры, способные связываться с мишенью в ее нативной конформации.

LIGS

Метод позволяет выявлять высокоселективные аптамеры против заранее определённого эпитопа, экспрессируемого на поверхности клетки. Моноклональное антитело взаимодействует со своим когнатным эпитопом, вытесняя и замещая специфичные аптамеры из обогащённого пула SELEX.

SAXS

Этот метод используется для определения различий в наномасштабной плотности образца. Это позволяет определить размер и форму макромолекулы.

HT SELEX

HT SELEX — метод, повышающий чувствительность по сравнению с традиционными методами клонирования и секвенирования и сокращающий число раундов, необходимых для достижения обнаруживаемого обогащения.

ЧТО ВЫ ПОЛУЧИТЕ

Информация о сродстве и специфичности аптамера

Информация о сродстве и специфичности аптамера

Сродство связано с силой взаимодействия между аптамером и его мишенью. Обычно аптамеры с медленной скоростью диссоциации демонстрируют сильное взаимодействие со своей мишенью. Такие аптамеры с высоким сродством способны связывать низкие количества мишени, что делает их чувствительными реагентами. Также при разработке любых диагностических тестов важно, чтобы аптамер распознавал только целевую мишень и не перекрестно реагировал с другими немишенными молекулами в смеси образца. Это избирательное связывание аптамеров с выбранной мишенью и ни с чем другим во всей смеси образца определяется как специфичность. Мы можем предоставить вам информацию об аптамерах с наибольшим сродством и специфичностью к вашей мишени.

ФЛУОРЕСЦЕНТНАЯ ПОЛЯРИЗАЦИЯ

Метод флуоресцентной поляризации может быть использован для оценки взаимодействия аптамеров с мишенями-малыми молекулами, такими как пептиды и белки. Этот подход основан на механизме индуцированного соответствия нуклеиновых аптамеров, который позволяет преобразовать событие связывания малой молекулярной мишени в детектируемый сигнал флуоресцентной анизотропии.

ДАННЫЕ ЛАЗЕРНОЙ СКАНИРУЮЩЕЙ МИКРОСКОПИИ

Данные лазерной сканирующей микроскопии можно использовать для визуальной иллюстрации связывания аптамера с мишенью

ДАННЫЕ ПРОТОЧНОЙ ЦИТОМЕТРИИ

Проточная цитометрия позволяет проводить количественный многопараметрический анализ популяций мишени (клеток, белков, вирусов и т.д.) на основе связывания мишени с лигандом. Этот метод используется для получения информации о специфичности и сродстве аптамеров.

УЧЁНЫЕ, УЧАСТВУЮЩИЕ В ИССЛЕДОВАНИИ

Меняя ваше мышление — мы меняем мир
ГЛАВНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬ

АННА КИЧКАЙЛО

Кандидат биологических наук, доцент
Меняя ваше мышление — мы меняем мир
ВЕДУЩИЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬ

АННА БЛАГОДАТОВА

Кандидат биологических наук
Меняя ваше мышление — мы меняем мир
ВЕДУЩИЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬ

ОЛЬГА КОЛОВСКАЯ

Кандидат биологических наук
Меняя ваше мышление — мы меняем мир
ВЕДУЩИЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬ

ГАЛИНА ЗАМАЙ

Кандидат биологических наук

ЗАКАЗАТЬ ХАРАКТЕРИЗАЦИЮ

CRM-форма появится здесь
We use cookies
Cookie preferences
Below you may find information about the purposes for which we and our partners use cookies and process data. You can exercise your preferences for processing, and/or see details on our partners' websites.
Analytical cookies Disable all
Functional cookies
Other cookies
We use cookies to personalize content and ads, to provide social media features and to analyze our traffic. Learn more about our cookie policy.
I understand Details
Cookies